Terve,
keräsin alkuvuodesta kaikenlaista kasvisälää kosteakammioon, limasienet mielessäin, mutta hangesta törröttäneen siankärsämön (Achillea millefolium) varrelle ilmestyikin runsaana jotain kotelosientä.
Tutkailin vähän FTE:tä ja päädyin itiöiden perusteella sukuun Diaporthe tai ainakin jonnekin Diaporthaceae tienoille. Osaisiko joku auttaa lajin kanssa? Ajattelin ensin vanhempien kuvausten itiökoon ja kasvutavan perusteella, että voisi olla D. arctii, kun sitä oli raportoitu siankärsämöltä, mutta ainakin Udayanga ym. (2015 Fungal Biology) pitävät sitä pelkästään takiaisten (Arctium spp.) lajina. Sitten mietin D. eres s.l., millä näyttää olevan aika laaja isäntäkirjo ja voi kasvaa vastaavalla tavalla yksitellen, mutta tällä on ehkä vähän pitkät itiöt kuvauksiin verrattuna.
Kaulat noin 0,2–0,5 mm pitkiä. Halkaisukuvia en näistä saa ilman preparointimikroskooppia. Askukset 8-itiöiset, I−, 49,7–52,5 × 7,1–8,3 µm. Itiöt vedessä (13,5) 14,1–15,9 (16,2) × (3) 3,5–4,1 (4,5) µm, 1-septaisia, 4 pisaraa, pienet ulokkeet päissä.
1 Like
Mahdollisesti Diaporthe orthoceras. Näin kirjoittaa Wehmeyer (1934):
Hyvä ehdotus, kiitos. Luin vain Wehmeyerin 1933 brittilajistoa ja siinä ei ollut tuota. Harmi ettei lajista ole sekvenssitietoa ja muutenkin kovin vähän löytyy esim. scholarilla muuta kuin yksittäisiä mainintoja siellä täällä. Parhaiten tuo kuitenkin tähän mennessä sopii.
Nyt löytyi sitten Diaporthe arctii joltakin takiaiselta, uskoakseni seittitakiaiselta (Arctium tomentosum). Tuokin toki lajikompleksi ja takiaisella kasvaa useampi Diaporthe, mutta ehkä uskallan väittää että kyseessä arctii sensu stricto kun mikään muu ei sovi.
Kauheasti erilaisia itiöitä löytyi. Mutta onpahan vertailtavaa lajikuvauksiin, kun joka artikkelissa on dokumentoitu eri lajeille eri itiöitä…
Laita talteen ja sekvensseihin. Ei maksa kuin pari euroa vaikka sekventoisi omakustanteisesti ja museolle voi taas tulla ilmaistakin tarjolle. Varmasti viimeistään ensi syksynä lähtee settiä myös Hartelle sekvensoitavaksi. Tuskin näistä on montaakaan kotimaista sekvenssiä olemassa, jos yhtään?
Itselläni on kovasti samanoloista paraillaan kosteakammiossa härkäpavun varsilla, mutten ole näitä koskaan skooppaillut. Täytyy varmaan kuivata varsi tai pari näytteeksi.
Juu näytteet on tallessa. ITS yksinään on vähän heikko vaihtoehto näiden erotteluun, mutta voi niitä toki silti kartoittaa.
Gao ym. (2017) Diaporthe is paraphyletic | IMA Fungus | Springer Nature Link
“In recent years, however, a polyphasic approach employing multi-locus DNA data together with morphology and ecology has been employed for species delimitation in the genus (Udayanga et al. 2011, Gomes et al. 2013). The nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS), the translation elongation factor 1-α (TEF1), β-tubulin (TUB), histone H3 (HIS), and calmodulin (CAL) genes are the most commonly used molecular loci for the identification of Diaporthe spp. (Dissanayake et al. 2015, Udayanga et al. 2015, Huang et al. 2015, Santos et al. 2017). (. . .) However, defining species boundaries remains a major challenge in Diaporthe (Huang et al. 2015), which may be a consequence of limited sampling or the use of DNA loci with insufficient phylogenetic resolution (Liu et al. 2016). It has therefore been proposed that new species in the genus should be introduced with caution, and that multiple strains from different origins should be subjected to a multi-gene phylogenetic analysis to determine intraspecificvariation (Liu et al. 2016).”
Tässä Gomes ym. 2013 artikkelissa oli jotain markkerivertailuja:
“ITS – The locus could distinguish 75 of the 95 species (79 % success). It had difficulty separating: D. angelicae, D. arctii and
D. subordinaria (clades 17–19)…” (kladilista jatkuu…)
