Laji.fi | Tietoja foorumista | Käyttöehdot | Yksityisyys | Keskustelusuosituksia

Yksittäisen lajin tai lajiryhmän tietosivu

lajitietokeskus

#1

Voisiko esim. Perhoswikin materiaalia käyttää perhoslajien tietosivulla? Olen ne itse kirjoittanut, ja annan luvan kirjoitelmien käyttämiseen. Asiasta on kyllä ollut aikaisemmin puhetta Marko Mutasen kanssa. Suunnilleen kaikista pikkuperhosista on jo jotain juttua perhoswikissä.


Mihin lajien tietosivuja käytetään?
#2

Hyvä idea; kannatetaan!

Ja muillekin tiedoksi, että perhoswiki löytyy täältä: http://www.insects.fi/hyonteistietokanta/plugins-html/Wiki/Lepidoptera/Wiki.html?order=Lepidoptera

Esimerkki sukusivusta Bryotropha, jolla näkyy lajikuvaukset (löytyvät toki myös lajisivuilta): http://www.insects.fi/hyonteistietokanta/plugins-html/Wiki/Lepidoptera/Genus.html?username=&password=&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&auktor=Heinemann%2C%201870

Lajisivuilla olisi myös hienoa nähdä jonkinlainen grafiikka, esim. diagrammi aikuisten lentoajasta, jonka saisi muodostettua havaintojen perusteella automaattisesti. Tällaistahan käytetään jo mm. Hyönteisfoorumin kuvapankissa. Lentoaikadiagrammista näkisi esimerkiksi sen, tukeeko jonkin lajin lentoaika omaa määritystä, jos määritys on vielä auki.


#3

Yksi vaihtoehto voisi olla sellainen, että laji.fi-rajapinta mahdollistaisi sekä lajitekstien että lajikuvien lisäämisen ohjelmallisesti laji.fi-tietovarastoon. Lajikohtaiset tiedot voisi sitten hakea tietovarastosta ohjelmallisesti. Laji.fi-api näyttää jo sisältävänkin tämänkaltaisia toimintoja, mutta en ole vielä tutkinut, ovatko ne riittäviä. Tällä tavoin olisi api-rajapinnan avulla mahdollista tehdä kustomoituja vikisivuja eri tarkoituksiin.


#4

Hei,

Kuulostaa oikein hyvältä. Kuka on taho jonka puoleen voimme kääntyä teknisissä asioissa? Meidän pitäisi saada pääsy tietokantaan, jotta voimme tuoda sieltä tekstit Lajitietokeskuksen taksonikantaan.

Mitenkä on noiden kuvien tekijänoikeuksien laita, voisiko niitäkin tuoda tietosivuille?


#5

Aika paljon siellä taitaa olla mun ottamia kuvia. Ikävä kyllä niistä iso osa on aika surkeita ja ne pitäisi kuvata uudelleen.
Enimmäkseen tekijänoikeudet lienevät "Free for non-commercial use" lisenssillä.

Kuvalista löytyy linkistä (en tiedä milloin päivitetty)
http://www.insects.fi/kuvapankki/imagelists/LEP_lajikuvat.htm


#6

Turhaa vaatimattomuutta, @Mali. Kuvasi ovat erinomaisia verrattuna siihen, ettei niitä olisi. Käytän Kuvapankkia ja Perhoswikiä jatkuvasti tietolähteinä, joten ne ovat tulleet hyvinkin tutuiksi.

Kannatan toki lisää kuvia ja parempia kuvia, mutta niitä odotellessa mikä tahansa on tietoarvoltaan parempi kuin ei mitään.

Tosiaan valtaosa kuvista on lisenssillä 'Free for non-commercial use', mutta osa on myös lisenssillä 'No rights reserved'. Pieni osa vanhemmista kuvista voi olla myös lisenssillä 'All rights reserved' (jäänne ajalta, kun tämä lisenssi oli mahdollinen), joten niitä ei saa käyttää ilman kuvaajan erillistä lupaa.


#7

Muutama sata Kuvapankin kuvaa on suuremmassa koossa Kotkassa ja Pinkassa.


#8

Vikin lajitietoja voi hakea seuraavasti:

http://www.insects.fi/wikimanager/json?op=getSpeciesText&order=Lepidoptera&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&species=terrella&topic=description

http://www.insects.fi/wikimanager/json?op=getSpeciesText&order=Lepidoptera&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&species=terrella&topic=biology

http://www.insects.fi/wikimanager/json?op=getSpeciesText&order=Lepidoptera&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&species=terrella&topic=links

http://www.insects.fi/wikimanager/json?op=getSpeciesText&order=Lepidoptera&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&species=terrella&topic=literature

Lähinnä ehkä 'description' ja 'biology'-osiot ovat käyttökelpoisia pienen siistimisen jälkeen. 'links' ja 'literature' -sektioissa on liikaa html-koodia. Vikin lajinimistö ei ole kaikilta osin ajan tasalla (en ole jaksanut päivittää), joten jokunen tekstisisältö saattaa olla tavoittamattomissa.

Kuvapankista saa tietyn lajin kuvalistan seuraavasti:

http://www.insects.fi/insectimages/json?op=getImageData&order=Lepidoptera&family=Gelechiidae&genus=Bryotropha&species=terrella


#9

Yksittäiseen kuvapankin lajikuvaan voi viitata seuraavasti:

http://insects.fi/kuvapankki/images/Lepidoptera/Gelechiidae/Bryotropha/terrella/Bryotropha%20terrella%2001.jpg

Yhdistettynä erikseen haettuun kuvalistaan, tietyn lajin kuvien lataaminen kuvapankista laji.fi-portaaliin saattaisi olla suhteellisen helposti automatisoitavissa.


#10

Lisättäköön tähän ketjuun että minun kuvani ovat vapaata riistaa lajitietokeskuksen käyttöön, vaikka taitavat ne kaikki olla "Free for non-commercial" joka tapauksessa. Kokonaan eri juttu on, että parilta viime vuodelta löytyy kuvista myös suuremman resoluution versiot.


#11

Niin ja näissä on todennäköisesti eri kuvannimi. Eli tuplia ei taida pystyä automaattisesti karsimaan?


#12

Havaintoselaimen kehittelyssä on nyt saavutettu sellainen merkkipaalu, että uusia havaintoja voi listata :slight_smile: Mallia on otettu lajitietokeskuksen vastaavasta toiminnosta:

Havaintoriviä klikkaamalla saa näkyviin tietoja valitusta lajista:

Lähinnä ylläoleva demonstroi sitä, kuinka kuvapankin ja vikin api-rajapintaa voi hyödyntää. Vikin suhteen tuli aikoinaan tehtyä onneton ISO-8859-1 merkistövalinta. Hieman on hankalaa saada Node.js-ohjelmalla tekstiä UTF-8-muotoon...

SuperAgent-koodi:

request      
.get( 'http://www.insects.fi/wikimanager/json' )    
.query({ op: 'getSpeciesText',
         topic: 'description',
         order: order,  
         family: family, 
         genus: genus,
         species: species })                                       
.then(function(res) 
{ 
   ...
}

#13

Hienoa työtä, Matti! :slight_smile:


#14

Listauksen viimeisellä rivillä näkyy havainto lajista Nymphalis io. Se on tuolla nimellä Hyönteistietokannassa. Laji.fi käyttää kuitenkin nimeä Aglais io:

"unit": {
    "abundanceString": "1",
    "unitId": "http://tun.fi/KE.423/3707-3341-2308-2416#Unit",
    "taxonVerbatim": "Nymphalis io",
    "recordBasis": "HUMAN_OBSERVATION_UNSPECIFIED",
    "mediaCount": 0,
    "linkings": {
      "taxon": {
        "vernacularName": {
          "fi": "neitoperhonen",
          "sv": "påfågelöga"
        },
        "scientificName": "Aglais io",
        "species": true,
        "qname": "http://tun.fi/MX.60914"
      }
    },
    "notes": "Talvehtimassa halkovajassa, valokuva tai muu tallenne"
},

/warehouse/query/list -haku on kuitenkin niin hyvin tehty, että havainto löytyy molemmilla lajinimillä. Tuon listauksenkin pitäisi kyllä käyttää Aglais io nimeä...


#15

Toinen huomionarvoinen seikka on listauksessa Conistra vacciniin kohdalla oleva kunta 'Espoo/Kauniainen'. Alkuperäisessä havainnossa on kunnaksi ilmoitettu Espoo, mutta järjestelmä on koordinaattien perusteella määritellyt kunnaksi Kauniainen.

"gathering": {
  "municipality": "Espoo",
  "biogeographicalProvince": "N",
  "team": [
    "Janne Sinkkonen"
  ],
  "coordinatesVerbatim": "668291:337439 FI KKJ27",
  "interpretations": {
    "sourceOfCoordinates": "REPORTED_VALUE",
    "finnishMunicipality": "http://tun.fi/ML.643",
    "sourceOfFinnishMunicipality": "COORDINATES",
    "sourceOfBiogeographicalProvince": "COORDINATES",
    "sourceOfCountry": "COORDINATES",
    "biogeographicalProvince": "http://tun.fi/ML.253",
    "coordinateAccuracy": 10,
    "municipalityDisplayname": "Kauniainen",
    "countryDisplayname": "Suomi",
    "biogeographicalProvinceDisplayname": "Uusimaa (U)",
    "country": "http://tun.fi/ML.206"
  },

#16

Aglais io (MX.60914) on Lajitietokeskuksessa lajin varsinainen nimi ja sillä on synonyyminimet Inachis io, Nymphalis io.

Havainto on tehty alkuperin Nymphalis io nimellä ja se on tulkittu taksoniksi MX.60914 synonyyminimen avulla.

Antamassasi JSON:ssa "taxonVerbatim" on alkuperäinen nimi ja linkings.taxon.scientificName on lajin tieteellinen nimi Lajitietokeskuksessa.

Jos haluat listaukseen nykyisen nimen ilmoitetun nimen sijasta, voit käyttää tuota linkings.taxon -osion tietoa.

(jos taxonVerbatin nimeä ei onnistuta liittämään mihinkään taksoniin, unit.linkings.taxon on tyhjä)


#17

Tutkimme tätä Espoo/Kauniainen ongelmaa


#18

Lisäsin lajin havainnoijia varten toisen välilehden:

Taulukon voi järjestää haluamansa sarakkeen mukaan:

Alueeksi voi antaa maakunnan, kunnan tai paikan:


#19

Lisätty 'Kuvat'-välilehti, johon kuvat haetaan Kuvapankista. Olisi hyvä, jos api:n kautta saisi listan erikseen valikoiduista kuvista, jolloin ne voisi lisätä kuvalistaan. Tällä hetkellä
GET /warehouse/query/list palauttaa aika sekalaisen valikoiman kuvia...